Na to, aby sa už dostal už dosť ohromujúci brzdný účinok modelu Z1000 na ďalšiu úroveň, boli implementované brzdové komponenty, ako sú tie, ktoré sa nachádzali na Ninja H2R. Brembo komponenty sú najlepšie dostupné pre masovo vyrábaný model. Vysoko presné ovládanie dodáva brzdnú silu lineárne, čo prispieva k vynikajúcej ovládateľnosti.